| Kolo | Datum zápasu | Domácí | - | Hosté | Skore |
| 16. | Ne 08.03.2020 10:15 | FK Dukla Praha B (Juliska UT) | - | SK Zápy | 3:4np |
| 17. | Ne 15.03.2020 14:30 | SK Zápy | - | TJ Sokol Živanice | |
| 18. | So 21.03.2020 10:15 | FK Zbuzany 1953 | - | SK Zápy | |
| 19. | So 28.03.2020 10:15 | FK Pardubice B | - | SK Zápy | |
| 20. | Ne 05.04.2020 16:30 | SK Zápy | - | SK Sokol Brozany | |
| 21. | Ne 12.04.2020 10:15 | FC Hradec Králové B | - | SK Zápy | |
| 22. | Ne 19.04.2020 17:00 | SK Zápy | - | FK Chlumec nad Cidlinou | |
| 23. | So 25.04.2020 17:00 | TJ Jiskra Ústí nad Orlicí | - | SK Zápy | |
| 24. | Pá 01.05.2020 17:00 | SK Zápy | - | TJ Sokol Velvary | |
| 25. | Ne 10.05.2020 10:15 | FC Slovan Liberec B | - | SK Zápy | |
| 26. | Ne 17.05.2020 17:00 | SK Zápy | - | FK Teplice B | |
| 27. | Ne 24.05.2020 17:00 | FK Jablonec B (areál Břízky) | - | SK Zápy | |
| 28. | Ne 31.05.2020 17:00 | SK Zápy | - | FK Mladá Boleslav B | |
| 29. | Ne 07.06.2020 10:15 | Bohemians Praha 1905 B (Uhříněves) | - | SK Zápy | |
| 30. | Ne 14.06.2020 17:00 | SK Zápy | - | FK Přepeře | |
